Военно-транспортный факультет в учреждении образования «Белорусский государственный университет транспорта» создан в соответствии с Постановлением Совета Министров Республики Беларусь № 775 от 11 июня 2003 года.
Факультет формировался на базе военной кафедры, созданной в 1953 году.
С 1 сентября 2004 года были образованы две кафедры: общевойсковой подготовки и военно-специальной подготовки.
С этого времени факультет осуществляет подготовку офицеров для Вооруженных Сил по специальности «Управление подразделениями железнодорожных войск» (квалификация — специалист по управлению – инженер) по направлениям.
В 2005 году при непосредственном участии подразделения Департамента железнодорожных войск в поселке Березки Гомельского района был создан Учебно-полевой центр факультета.
На период обучения курсанты обеспечиваются всеми видами довольствия, на них распространяются все льготы, предусмотренные для военнослужащих, выплачивается стипендия.
Выпускники факультета достойно проходят службу в различных силовых структурах и приумножают традиции вуза.