Военно-транспортный факультет в учреждении образования «Белорусский государственный университет транспорта» создан в соответствии с постановлением Совета Министров Республики Беларусь № 775 от 11 июня 2003 года.
С 1 сентября 2004 года были образованы две кафедры: общевойсковой подготовки и военно-специальной подготовки. С этого времени факультет осуществляет подготовку офицеров для Вооруженных Сил по специальности «управление подразделениями железнодорожных войск».
В 2005 году при непосредственном участии подразделения департамента железнодорожных войск в поселке Березки Гомельского района был создан учебно-полевой центр факультета.
Подготовка офицеров для замещения первичных офицерских должностей (с присвоением звания лейтенант) производится со сроком обучения 4 года.
На период обучения курсанты обеспечиваются всеми видами довольствия, на них распространяются все льготы, предусмотренные для военнослужащих, выплачивается стипендия. Курсанты проживают в общежитии университета. Два раза в год (в зимний и летний периоды) курсантам предоставляется каникулярный отпуск продолжительностью 14 и 30 суток.